humanity is the awkward prepubescent phase between animal and machine

blog:personal

211017 1231

CRISPR procesa un tā pielietojuma veidu atklāšana ir viens no nozīmīgākajiem sasniegumiem visā ģenētikas vēsturē, taču “tīrā veidā” tam ir virkne ierobežojumu. Piemēram, HDR jeb homoloģiski vadītās labošanas režīmā (kas, salīdzinot ar nehomologo lipīgo pavedienu galu savienošanas režīmu, ir daudz precīzāks un ar daudz mazāku nevēlamu blakuslabojumu varbūtību) CRISPR process darbojas tikai šūnu dzīves cikla agrīnajās fāzēs, kas nozīmē, ka to nevar izmantot pie pieaugušām šūnām, kas ir pārstājušas dalīties. Problēma ir tajā, ka tipiski šāda šūnu veida pārstāvji ir lielākā daļa smadzeņu neironu, kas būtiski ierobežo CRISPR metožu pielietošanu neirozinātnes nolūkiem.

Pirms gada es prognozēju, ka CRISPR varētu būt izmantojams pie pieaugušiem neironiem, izmantojot papildus soli, piem., virāli mediētas bioluminiscentās optoģenētikas metodes. Specifiski BL-OG un CRISPR metožu kombinācijas pielietojumu praksē vēl neviens, cik man zināms, nav pārbaudījis, taču nesens pētījums pa visai līdzīgu līniju beidzot ir pavēris iespēju pielietot pilnu CRISPR instrumentāriju arī smadzeņu ģenētiskai modificēšanai.

Runa ir par t.s. vSLENDR jeb “viral mediated single-cell labeling of endogenous proteins by CRISPR-Cas9-mediated homology-directed repair” protokolu, kas CRISPR sekvenci kopā ar mērķa sekvenci un Cas9 vai citu funkcionālo proteīnu nogādā šūnās ar standarta adenoasociatīvā vīrusa (AAV) transfekcijas palīdzību, tādējādi apejot vajadzību pēc izmaiņu replikācijas caur šūnu dalīšanos.

Ir sagaidāms, ka šīs un līdzīgas tehnoloģijas beidzot ļaus izmantot precīzijas gēnu inženieriju arī smadzeņu neironu pētniecībā, ko kā perspektīvu ir grūti novērtēt par augstu.


tags: , , , , , ,
state: working
sound: Trent Reznor - Quake OST: The Hall Of Souls

21917 0015

Pulkvežleitnants Staņislavs Jevgrafovičs Petrovs, cilvēks, kurš 1983. gada 26. septembrī vienpersoniski izglāba pasauli no kodolkara, 1939-2017.


tags: , , , ,
state: working
sound: Oda Relicta - Holy Alliance: The Departed, The Immortal

2617 2100

This is a reminder that we now live in a time where exist things like universal-adjacent digital-to-biological converters and solar-powered cyborg dragonflies with optogenetic brain-computer interfaces.

tags: , , , , , ,
state: awake
sound: Ager Somnus - Book Of The Black Earth: Awakening

23517 1330

Last year, it was still quite humanlike when it played,” Mr. Ke said after the game. “But this year, it became like a god of Go.” [..] “AlphaGo is improving too fast,” he said in a news conference after the game. “AlphaGo is like a different player this year compared to last year.”

AlphaGo turpina nostiprināt savas pozīcijas un iezīmē nākotnes tendences.

Update: Oficiālā pasākuma lapa, ar maču ierakstiem, kopsavilkumiem u.c.


tags: , , , , , ,
state: working
sound: Kolhoosi 13 - Monuments Of Power: From Comradery To Sustenance

21417 1653

Neuralink, eksokorteksa risinājumu R&D kompānija un Maska kārtējais megaprojekts, beidzot ir iznākusi publikā un to pavada lielisks un masīvs “Wait But Why” enciklopēdijbloga raksts, ko iesaku izlasīt visiem, kam kaut pa pieskari interesē šī tematika (ieskaitot tos, kuriem nav problēmu ar pašu papīru un publikāciju lasīšanu, jo WBW autoru uzražotos rakstus vismaz mana necilā persona atrod arī par labu izklaidējošo materiālu). Citējot XKCD, “a huge and alien future is barreling toward us, and I can’t wait”.

Citās, ar šīm saistītās ziņās – Kernel, kompānija, kur T. Bergera hipokampa protēžu laboratorijas vecā komanda ar vairākiem jauniem un aizraujošiem papildinājumiem bīda līdzīgu tehnoloģiju izstrādnes mazliet citos virzienos, drīzumā nāks klajā ar progresa raportu; sekosim līdzi.


tags: , , , , , , , , ,
state: working
sound: Human Error - Endure Yourself: Man-Made Man

26217 0318

Kohs et al. no Allena institūta peļu smadzenēs atklājuši trīs claustrum apgabalā sakņojošamies neironus, kuru arbors aptver lielāko daļu smadzeņu garozas, iesniedzoties “lielākajā daļā vai visos tajos smadzeņu apgabalos, kas saņem informāciju no maņām un vada kustības”, tulkojums mans.

Pagaidām nav zināma šo neironu funkcija (vēl nav nopublicēta pat pilna morfoloģija un gēnu ekspresija), bet, ņemot vērā to, ka claustrum ir empīriski saistīts ar apzinātiem smadzeņu stāvokļiem, ir iespējams, ka šādi “visaptveroši” neironi varētu kalpot par globālās darba telpas sinhronizācijas līdzekļiem, ar starpneironu trūkumu panākot īpaši ātru signāla pārraidi starp savstarpēji attāliem garozas apgabaliem.

Nākamie soļi: noskaidrot, vai cilvēku smadzenēs ir atrodams kas līdzīgs, noskaidrot, cik lielu claustrum neironu proporciju sastāda šī tipa neironi.


tags: , , ,
state: awake
sound: Alphaxone & protoU - Stardust: Returned

15316 1109

AlphaGo won the last match. The final score of the challenge event: 4-1 in favor of the machine.

tags: , , , ,
state: awake
sound: Empusae - Error 404 Metaphorical Loss: Alkevar

9316 1147

Citās ziņās – AlphaGo uzvar pirmo maču no pieciem pret Lī Sedolu.

Update: un otro, un trešo.

AlphaGo doesn’t actually play kami no itte, but human professionals can’t detect AlphaGo’s departures from it.

Update:uzvar ceturtajā mačā.


tags: , , , ,
state: working
sound: Alcest - Les Voyages De L'Âme: Summer's Glory

28116 1236

AlphaGo, a Google/DeepMind AI (a DNN-driven MCTS algorithm) defeats a European Go champion by 5 games to 0, will play against 9 dan professional Lee Sedol in March 2016.

Relevant xkcd, of course.


tags: , , , ,
state: awake
sound: Chants Of Maldoror - Every Mask Tells The Truth: Cruel With Us

26116 0231

Mārvins Minskijs, viens no mākslīgā intelekta pētījumu pamatlicējiem, ir cietis no asinsizplūduma smadzenēs un (visticamāk; pagaidām nav izdots paziņojums, bet, ņemot vērā viņa klienta, zinātniskā padomnieka un ilggadēja krionikas proponenta statusu, tas ir augstākās varbūtības scenārijs) tiek kriosaglabāts “Alcor” klīnikā.

For most people, the waiting and fear is over when you hear about the death. For us, it’s just beginning.


tags: , , ,
state: blank
sound: Autoclav1.1 - Embark On Departure: Stop The Clock

3116 1507

Aizgājušais gads ir bijis ļoti nozīmīgs gan teorētiskās, gan praktiskās gerontoloģijas jomā. Daudz jaunu sasniegumu un pavedienu turpmākiem pētījumiem, sākti pirmie pretnovecošanas gēnu terapijas eksperimenti pie pacientiem, pirmoreiz demonstrēts pilna organisma kriokonservācijas atgriezeniskums, pretnovecošanas tehnoloģiju R&D iesaistījusies Google un P. Tjēls, utt., utjpr.

Pagaidām izskatās, ka uz iepriekšējā piecgadē liktajiem pamatiem beidzot sāk veidoties reālu, pragmatisku pētījumu un izstrādņu struktūra (paralēli līdzīgas norises un panākumi ir vērojami WBE/​SIM/​smadzeņu digitizācijas lauciņā, bet par to citu reizi, gk. tādēļ, ka par tiem neviens nav uzrakstījis glītu kopsavilkumu).


tags: , , , , ,
state: working
sound: Xmal Deutschland - Viva: Eisengrau

2116 2041

Rogozins uztraucas par to, ka SpaceX varētu apdraudēt Krievijas kosmosa programmu. Citās ziņās – izskatās, ka Krievijas kosmosa programma ir tādā stāvoklī, ka Роскосмос tiek avārijas kārtā apvienots ar renacionalizēto URSC, jo, citējot Rogozinu, “[Krievijas] kosmosa apguves industrija kā sektors ir tik nestabila, ka ir vajadzīgs to nodot valdības pārziņā”. Vēl citās ziņās – SpaceX sekmīgi nosēdinātā nesējraķetes pakāpe ir atkārtotai lietošanai piemērotā kondīcijā. Visbeidzot, SpaceX un NASA noslēdz kontraktu par pirmās pakalpojumu izmantošanu astronautu transportam uz SKS.

Mana (pagaidām ļoti aptuvenā, bez varbūtībām vai ticamības intervāliem) prognoze: līdz 2020. gadam Krievijas kosmosa programma būs vai nu sašķēlusies starp bojā ejošu valsts sektoru un uzplaukstošām nevalstiskām kompānijām, vai kopumā sarukusi līdz tikai vietējas nozīmes pasākumam. Abos scenārijos globālā mērogā vadībā izvirzās nevalstiskās kosmosa apguves kompānijas, gan ASV, gan citur pasaulē.


tags: , , , , ,
state: awake
sound: Tenhi - Kauan: Taival

221215 1648

DSI Studio ir labs, bet lēns rīks (no otras puses, pašu attiecīgo algoritmu lielais O ir diezgan šausmīgs, līdz ar to it kā par velti sūdzos (no trešās puses, tas pasākums lielākoties ir apkaunojoši paralēls, līdz ar to offloadošana uz GPU vai MPI atbalsts būtu jauki)), HCP WU-Minn datu sets 25-35 g. veciem indivīdiem miera stāvoklī (44.6 GB) procesēsies vismaz līdz pusnaktij, savukārt, velkot minēto datu apdeitu, Firefokša Aspera plugina svaigākā versija iesākumā lūza un kārās ik pēc dažām minūtēm.

Secinājums – ar galdniecību šodien nesanāks nodarboties, būs jāšūpo kājas (jo a.m. izklaides tērē > 75% darbstacijas samērā dāsnā RAMa), jāstrebj kafija daļējā tukšgaitā un jālasa kaut kas relevants no “Mēbeļu Vēstneša” (h/t [info]hedera). Vai, vēl izlaidīgāk, jāapskata netehniskās literatūras lasāmliste. Kas nav apskatīta nu jau vismaz nedēļu. Hm.

Citās ziņās, history has been made – SpaceX Falcon 9 nesējraķetes pakāpe ir sekmīgi nosēdināta.


tags: , , , , , ,
state: awake
sound: Covenant - United States Of Mind: Unforgiven

211215 1147

Iespējams, ka Bergera et al. izstrādātajai hipokampa augmentācijai ir ne tikai atmiņas uzlabošanas, bet arī atmiņas satura “šārēšanas” potenciāls.

tags: , , , ,
state: working
sound: The Azoic - Forward: Evolution

161215 1312

ATLAS and CMS report a potential new boson at 750 GeV (3.6 and 2.6 sigma, respectively).

tags: , , , ,
state: working
sound: Stray - Abuse By Proxy: Overcome

91215 1403

Finally, the expected speed-ups from D-Wave, “~ 108 times faster than an optimized implementation of QMC on a single core”.

Update: This is a bit embarrassing, I should have paid closer attention to the performance comparison graph (Fig. 4). There is indeed an exponential speed-up over simulated annealing but only a linear one over QMC. Also, see S. Aaronson’s article for more in-depth explanation of some of the potential problems with the interpretation of the results.


tags: , , , ,
state: working
sound: Ugasanie - Eye Of Tunguska: The Bodies Under The Snow

31215 2315

Būtu smieklīgi, ja nebūtu tik stulbi: iespējams, ka havajiešu šamaņu vēlmes dauzīt bungas un šūpot zvanus izmeklētās vietās dēļ ir ticis zaudēts plānotais TMT teleskops. “Natural and cultural environment” my arse, ņemot vērā to, ka runa ir par akmeņainu vulkāna virsotni, ap kuru jau desmitiem gadu tiek būvētas un aktīvi izmantotas masīvas observatorijas. Labi vismaz, ka EELT tiks būvēts Čīlē.

tags: , , , , , ,
state: working
sound: Rome - Die Æsthetik Der Herrschaftsfreiheit: To Be Governed

241115 1427

Jaunumi no Optalysys.


tags: , ,
state: working
sound: The Merry Thoughts - Millenium Done: Pale Empress

161115 0303

Kvantu aļģes un VRT simtgades jubileja.

tags: , ,
state: awake
sound: In Slaughter Natives: Insanity & Treatment: Sacred Worms

131015 1917

Pirmais pretnovecošanas gēnu terapijas mēģinājums pie pacientiem. Sekosim līdzi.

tags: , , , , ,
state: working
sound: Hungry Lucy - Pulse Of The Earth: Balloon Girl
Powered by Sviesta Ciba