Human is the awkward liminal phase between animal and machine

31024 0949

A human brain imaged at synaptic resolution would yield a zettabyte of data (1e21 bytes). Our ultimate goal is to enable zettascale connectomics.

https://zetta.ai/

18924 0012

Turpinājums no iepriekšējā: Neuralink ir saņēmis FDA zaļo gaismu klīniskajiem testiem redzes atjaunošanai.

https://x.com/neuralink/status/1836118060308271306

23824 1334

Otrais case study no Neuralink klīniskajiem testiem: https://neuralink.com/blog/prime-study-progress-update-second-participant/

Pagaidām izskatās jo tālāk, jo daudzsološāk.

15824 0934

Beidzot ir zināms iespējamais placebo efekta mehānisms: https://www.nature.com/articles/s41586-024-07816-z

22724 0736

Viena novecojot upregulēta iekaisuma marķiera inhibēšana dod 25% veselas (samazināta audzēju incidence, uzlabots glikozes metabolisms, novērsts muskuļu masas zudums, būtiski palēnināta telomēru sarukšana) dzīvildzes (healthspan un lifespan) pieaugumu pelēm: [1]

Drīz sāksies uz šo pašu mehānismu bāzētas idiopātiskās plaušu fibrozes terapijas klīniskie testi [2][3][4][5][6], būs iespēja novērot efektu pie pacientiem, ir zināms, ka cilvēkos IL-11 darbojas līdzīgos veidos [7].

Pārdomas — rapamicīns mērķē uz mTOR metabolisma ceļu, kas ir daļa no IL-11 ietekmētajiem mehānismiem, un ir ar jau zināmiem pretnovecošanas efektiem [8], būtu interesanti paskatīties, vai abas terapijas sinerģizē.

[1] https://www.nature.com/articles/s41586-024-07701-9
[2] https://doi.org/10.1164/ajrccm-conference.2023.207.1_MeetingAbstracts.A6262
[3] https://doi.org/10.1042%2FBCJ20220160
[4] https://clinicaltrials.gov/study/NCT05740475
[5] https://clinicaltrials.gov/study/NCT05658107
[6] https://clinicaltrials.gov/study/NCT05331300
[7] https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.aba8146
[8] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9173851/

6724 1158

Daļējs kopsavilkums šobrīd publiskajiem praktiskās gerontoloģijas pētījumiem ar stadijām un progresu:

https://www.lifespan.io/road-maps/the-rejuvenation-roadmap/

26624 0159

Bioinženierija uz AI bāzes ir klāt.

1. https://doi.org/10.1126/science.adl2528
2. https://doi.org/10.1038/s41586-023-05696-3
3. https://doi.org/10.1101/2024.04.22.590591
4. https://doi.org/10.1126/science.abn2100
5. https://www.profluent.bio/blog/editing-the-human-genome-with-ai
6. https://www.evolutionaryscale.ai/blog/esm3-release
7. https://www.nature.com/articles/d41586-024-02214-x

21624 2137

Mazmolekulārs TERT aktivators revertē novecošanas marķierus in vitro un in vivo modeļos, bez evidences par palielinātu kanceroģenēzes risku.

https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(24)00592-0

5624 1350

Sperti pirmie praktiskie soļi revertējamas krionikas virzienā: vecā procedūra, jauns krioprotektanta-vitrifikanta sastāvs.

[..] cryopreservation of diverse brain organoids or human brain tissue without disrupting the neural cytoarchitecture or functional activity.

https://www.cell.com/cell-reports-methods/fulltext/S2667-2375(24)00121-8

14524 1929

Izlaisti dati no pirmā labā (~ 30 nm) izšķirtspējā digitizētā cilvēka smadzeņu kubikmilimetra.

1. https://www.science.org/doi/10.1126/science.adk4858
2. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.29.446289v4
3. https://h01-release.storage.googleapis.com/explore.html
4. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.29.445828v1

Kā jau bija gaidāms, datu apjoms ir milzīgs, bet jau tiek strādāts pie metodēm, kā to samazināt bez rezultātu ietekmējoša kvalitātes zuduma (sk. [4]).

1324 1103

Pagājušajā septembrī sāktā Neuralink klīniskā izmēģinājumu programma dod rezultātus, pirmā implantācija pacientam ir noritējusi sekmīgi. Gaidām publikāciju/tehnisko raportu.

Progress is good, and the patient seems to have made a full recovery, with no ill effects that we are aware of. Patient is able to move a mouse around the screen by just thinking.

https://pixeldrain.com/api/file/KNxChFMj

https://www.youtube.com/watch?v=F-LZ7GYFGrs

24124 2345

Gēnu terapija beidzot ienāk medicīnas praksē.

https://edition.cnn.com/2024/01/16/health/crispr-casgevy-beta-thalassemia/index.html

https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-approves-first-gene-therapies-treat-patients-sickle-cell-disease

10923 1611

Pārmaiņai pēc asenizācijas pasākumiem (AUC = 0.9996, precision = 0.9964, recall = 0.9933 no pusstundā uzcepta perceptrona pie randomas draņķības atpazīšanas uzdevuma ir good enough to prove my point un vairāk ievērības par to, ko dirsiens gēnu un baitu dīķī ir pelnījis anyway) un vilšanos sagādājušiem supravadītāju pētījumiem, laikam jāieposto kaut ko pozitīvu.

Par spīti vairākiem izgāzušamies agrīniem un pārsteidzīgiem startapiem, heterohronās parabiozes (asiņu transfūzijas no jauna organisma vecam) metodika novecošanas revertēšanai ne tikai turpina darboties, bet turpina parādīties jauni mehānistiski modeļi attiecīgā organisma atjaunošanās (somatiskas un kognitīvas, kas ļoti priecē) procesa izskaidrošanai! Šoreiz prožektora gaismā ir trombocītu atvasinātais augšanas faktors PF4 (kind of negaidīti, aktīva reģeneratīva funkcija no trombocītiem?) kombinācijā ar CXCR3 receptoru.

Pagaidām viss labums, kā parasti, tiek tikai pelēm, bet, ja lietas pa šo līniju turpinās notikt, paredzamā nākotnē var cerēt uz pirmo E. Batorijas vārdā nosaukto rejuvenācijas klīniku. :D

10322 2308

Kad komentēju, ka “viss jau ir sanācis”, es to domāju pilnā nopietnībā. Drīzumā sāksies R&D fāze mRNS vakcīnām pret 15 no pasaules bīstamākajām infekcijas slimībām [1], ieskaitot Ebolas drudzi un malāriju (pateicoties tehnoloģijas elastīgumam, mRNS vakcīnas var efektīvi izmantot plašam patogēnu spektram, neaprobežojoties tikai ar vīrusiem).

[1] https://www.reuters.com/business/healthcare-pharmaceuticals/moderna-plots-vaccines-against-15-pathogens-with-future-pandemic-potential-2022-03-08/

24122 1555

Jautājums primāri ir domāts šeit atlikušajiem foldotājiem, bet aicināti izteikties ir visi, kuri saprot, par ko ir runa.

Par AlphaFold esmu jau rakstījis, bet šī tehnoloģija šobrīd ir tikpat iespaidīga, cik pirms gada un, visticamāk, tās potenciāls ne tuvu nav izsmelts vai pat pilnībā ieskicēts. Tās jauda un potenciāls pēdējā laikā ir licis mazliet aizdomāties par Folding@home iniciatīvas nākotni un perspektīvām. Personīgi uzskatu, ka tai joprojām ir pielietojums, bet, tajā pašā laikā, nav izslēgts, ka redzam šāda veida eksplicītas distributētās skaitļošanas projektu atvirzīšanos fonā, to vietā stājoties skaitļošanai uz masīvu neirālo tīklu bāzes, gan mākonī, gan, apritē ieejot dažādu veidu AI paātrinātāju aparatūrai, arī “uz malas”.

Poll #21519 Folding@home in the Time of AlphaFold
Open to: All, results viewable to: All

Vai AlphaFold realizācija padara Folding@home iniciatīvu bezjēdzīgu?

Permanento pacientu balsis droši neņemt vērā.

2921 1704

Tā, kā biedrs Lamināts ir nolēmis manus komentārus pie viņa ierakstiem nerādīt, atļaušos izteikt savu entuziasmu pie sevis (nu jau divus ierakstus pēc kārtas, bet tas ir tas līmenis). Sintētiskās bioloģijas un gēnu inženierijas jomā šobrīd notiek masīvs progress ar iespaidīgiem taustāmiem rezultātiem un vēl iespaidīgākām prognozēm.

It’s going to allow us to not just edit genomes but also, and importantly, to write a new code for life — we will have write-level permissions.

https://www.weforum.org/agenda/2021/04/global-technology-governance-summit-gtgs-future/

9721 1554

Kamēr vietējie ludīti un folijnieki izdod skaņas par lielo, ļauno gēnu terapiju vakcīnās (tā nav gēnu terapija), karavāna iet tālāk reāla gēnu terapija turpina uzņemt apgriezienus, pie tam ļoti daudzsološos virzienos.

New intranasal and injectable gene therapy for healthy life extension no BioViva grupas, datiem pagaidām jāpieiet ar zināmu piesardzību, jo rezultāti pagaidām nav replicēti citur, bet, ja tur “viss ir tīrs”, tad šis varētu būt proaktīvas pretnovecošanas terapijas starta moments. Kā mēdz teikt, huge if true.

22121 2355

Lieliskas ziņas — būtisks progress multiplās sklerozes mRNS vakcīnas virzienā, izstrādā BioNTech, Pfizer COVID-19 vakcīnas ražotāji. Pētījums uz pelēm [1] rāda visai daudzsološus rezultātus simptomu uzlabošanas un progresijas apturēšanas ziņā.

Man šķiet, ka te mēs redzam tikai pašu pieticīgāko mRNS vakcīnu tehnoloģijas sākumu, ar šo tehnoloģiju vakcīnas var ražot ātri un mRNS spēj kodēt praktiski patvaļīgas antivielas.

[1] https://science.sciencemag.org/content/371/6525/145.full

181220 2342

Ja cilvēks vismaz dažos teikumos (bez špikošanas) nevar aprakstīt to, kas notiek šajā attēlā un kāda ir atšķirība starp abiem attēlotajiem scenārijiem, tad padomāt divreiz, vai ņemt vērā viņa viedokli par COVID-19 vakcīnām un par vakcināciju kā tādu (h/t Dr. D. Isarova).

41220 1427 : A new kind of science

Mākslīgā intelekta sistēmu sasniegumi šahā un go spēlē un pat tekstu sastādīšanā ir burtiski rotaļāšanās, salīdzinot ar AlphaFold.

Seno un līdz šim (par spīti visām Folding@home un citu iniciatīvu cienījamajām pūlēm) neatrisināto proteīnu locīšanas jeb strukturālo motīvu problēmu var uzskatīt par atrisinātu. Šāda sasnieguma nozīmi un tālejošās sekas var bez pārspīlējumiem salīdzināt ar tranzistora izgudrošanu, tas ir viens no zinātnes vēstures un zinātniski tehnoloģiskā progresa pagrieziena punktiem.

https://deepmind.com/blog/article/alphafold-a-solution-to-a-50-year-old-grand-challenge-in-biology
https://www.sciencemag.org/news/2020/11/game-has-changed-ai-triumphs-solving-protein-structures
https://www.nature.com/articles/d41586-020-03348-4
https://www.economist.com/science-and-technology/2020/11/30/how-do-proteins-fold