Human is the awkward liminal phase between animal and machine

31024 0949

A human brain imaged at synaptic resolution would yield a zettabyte of data (1e21 bytes). Our ultimate goal is to enable zettascale connectomics.

https://zetta.ai/

18924 0012

Turpinājums no iepriekšējā: Neuralink ir saņēmis FDA zaļo gaismu klīniskajiem testiem redzes atjaunošanai.

https://x.com/neuralink/status/1836118060308271306

23824 1334

Otrais case study no Neuralink klīniskajiem testiem: https://neuralink.com/blog/prime-study-progress-update-second-participant/

Pagaidām izskatās jo tālāk, jo daudzsološāk.

15824 0934

Beidzot ir zināms iespējamais placebo efekta mehānisms: https://www.nature.com/articles/s41586-024-07816-z

5624 1350

Sperti pirmie praktiskie soļi revertējamas krionikas virzienā: vecā procedūra, jauns krioprotektanta-vitrifikanta sastāvs.

[..] cryopreservation of diverse brain organoids or human brain tissue without disrupting the neural cytoarchitecture or functional activity.

https://www.cell.com/cell-reports-methods/fulltext/S2667-2375(24)00121-8

14524 1929

Izlaisti dati no pirmā labā (~ 30 nm) izšķirtspējā digitizētā cilvēka smadzeņu kubikmilimetra.

1. https://www.science.org/doi/10.1126/science.adk4858
2. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.29.446289v4
3. https://h01-release.storage.googleapis.com/explore.html
4. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.29.445828v1

Kā jau bija gaidāms, datu apjoms ir milzīgs, bet jau tiek strādāts pie metodēm, kā to samazināt bez rezultātu ietekmējoša kvalitātes zuduma (sk. [4]).

1324 1103

Pagājušajā septembrī sāktā Neuralink klīniskā izmēģinājumu programma dod rezultātus, pirmā implantācija pacientam ir noritējusi sekmīgi. Gaidām publikāciju/tehnisko raportu.

Progress is good, and the patient seems to have made a full recovery, with no ill effects that we are aware of. Patient is able to move a mouse around the screen by just thinking.

https://pixeldrain.com/api/file/KNxChFMj

https://www.youtube.com/watch?v=F-LZ7GYFGrs

26523 0503

FDA aprobē Neuralink klīnisko testu uzsākšanu.

261122 1516

Nogulēju sākumu BCI & Neurotech Masterclass Baltic Region 1.0 semināram. Cik labi, ka pasākumu ierakstīšana no opcijas ir kļuvusi par normu.

16922 1447

Pārlasot vecas piezīmes, izkristalizējās vesels jauns pētnieciskā darba virziens vai, kā minimums, materiāls pāris turpmākajiem papīriem. Būs jāsāk veidot personīgo arhīvu.

9822 1646

Novēloti pierakstīts secinājums: par spīti laba līmeņa pasniedzējiem un vispārīgi kompetentam mācību materiālam, Neuromatch Academy neiesaku nevienam, kam varētu nepatikt ļoti neveikli un uzbāzīgi organizēts obligāts grupu darbs (no otras puses, tas ir subjektīvi — izteiktiem ekstrovertiem varbūt tas būtu pašā laikā).

Atmetu ar roku un izstājos otrajā nedēļā, tā vietā tagad atkārtoti izeju Coursera UW CSE528 kursu ar veco, bet joprojām aktuālo Dajana un Abota grāmatu, šoreiz ar sertifikātu (pirmo reizi to izgāju tāltālajos laikos, kad oficiālu sertifikātu sistēmas Coursera vēl nebija).

Pēc tam, secībā:

• Human Neuroanatomy, UMich
• Advanced Neurobiology I, PKU
• Advanced Neurobiology II, PKU
• Neuroscience and Neuroimaging, JHU, 4 kursu baterija
• Medical Neuroscience, DU

Pašreizējā extracurricular-ā lasāmviela par un ap tēmu:

• Dehaene, S., Consciousness and the Brain
• Graziano, M., Rethinking Consciousness
• Eliasmith, C., Neural Engineering
• Eliasmith, C., How to Build a Brain

Vispārīgās pētnieciskās intereses pēc minētā 3 gadu pārtraukuma:

• Praktiski: joprojām statistisku konektomu automatizēta rekonstrukcija ar data-driven axonal guidance (manas RSU IRC19 prezentācijas temats)
• Teorētiski: semantisko pointeru arhitektūra [1][2], sk. arī abas C. Eliasmith grāmatas

Atpakaļ pie darba.

20522 0859

Pieteicos 3 nedēļu computational neuroscience kvalifikācijas celšanas kursiem Neuromatch Academy, šodien apstiprināja pieteikumu.

Ir dzirdētas dažādas atsauksmes par programmu un par pašu NMA pasākumu, bet atturēšos no priekšlaicīgiem spriedumiem. Abstraktā līmenī kursa programma izskatās neslikti priekš solīdas pamata lietu atkārtošanas, kas pēc manas 3 gadu pauzes varētu būt pašā laikā (īpaši pa comp. neurosc. un deep learning konjunkcijas līniju). Also, profesionāli un personīgi pazīstu vienu no mācībspēkiem un varu būt drošs, ka vismaz no viņa puses viss būs augstā līmenī, līdz ar to gan jau nebūs pavisam slikti.

14322 0013

Laikam ir laiks noslaucīt putekļus no pēdējos dažus gadus maz aiztiktās zinātnes. Jāpaceļ darbus no tās vietas, kur noliku pēc RSU Research Conference 2019 Digital Pathology eventa un jāturpina rakt. Beidzot jūtu, ka galvā kaut kas ir sācis salikties atpakaļ pareizajās vietās.

21220 2221

Komēdija vienā cēlienā ilustrācijā: pele laikam tik ļoti sastresojusies, ka smadzenes savilkušās čokurā. :D

Īpaši dīvaini ir tas, ka tālāk pašā papīrā, ir sazīmētas normālas, lisencefāliskas peļu smadzenes un pats papīrs arī, pa diagonāli pārlasot, izskatās ļoti piedienīgi.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867419311171

211120 1231

The very idea of humans being some sort of natural concept is really going to change. Our bodies will be so high-tech, we won’t be able to really distinguish between what is natural and what is artificial.

— The Fourth Industrial Revolution promotional video, World Economic Forum, April 13, 2016

Darām, ko varam.

11920 1311

There are no cat and dog people, there are Toxoplasma gondii and Toxacara canis people.

14720 1617

Mēģinu uzrakstīt pa pusei populāru kopsavilkumu saviem pēdējiem diviem un droši vien nākamajiem pieciem līdz desmit pētnieciskā darba gadiem. Pagaidām vēl nesaprotu, cik tehniski to visu pasniegt (un vai kādam no vispārīgās publikas tas varētu interesēt).

Update: Kolēģi iesaka rakstīt vismaz divos līmeņos — kompetentiem lajiem un blakusjomu speciem, varbūt arī ar ievadu pilnīgām tējkannām, ja pietiek pacietības.

25719 0402

Neuralink pārliecinoši rāda priekšzīmi [1][2] tam, kā jābūvē smadzeņu-datoru interfeisus. Publikācija apraksta tikai agrīnu koncepta demonstratoru ar virkni skaidri iezīmētu tālāku uzlabojumu, bet jau tas vien ir daudz iespaidīgāks par visiem iepriekšējiem lielo projektu gala rezultātiem, kopā ņemtiem (pie tam ar tikai nepilnu 3 gadu ilgu R&D fāzi).

We have built arrays of small and flexible electrode “threads”, with as many as 3,072 electrodes per array distributed across 96 threads. We have also built a neurosurgical robot capable of inserting six threads (192 electrodes) per minute. Each thread can be individually inserted into the brain with micron precision for avoidance of surface vasculature and targeting specific brain regions. The electrode array is packaged into a small implantable device that contains custom chips for low-power on-board amplification and digitization.

[1] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/703801v1
[2] https://www.youtube.com/watch?v=r-vbh3t7WVI

4419 0033

If I’ll ever have to write anything on emulating the substantia nigra, the title is going to be “Black Matter Lives”.

3419 1306

Mid-tier konferenču gļukainie monitori, piedegusī kafija un apkaltušie pīrādziņi ir dzīve. Šodien norunāju (šī pasākuma ietvaros) referātu par jaunu metodi pusautomātiskai konektomu rēķināšanai no MRI un statistikas, slaidus publiskosim šīmēneša beigās.