BIOĶĪMIJA
« previous entry | next entry »
Dec. 1., 2010 | 08:04 pm
posted by: psiihe in pajautaa
Sveiki Cibiņi!
Jautājums sekojošs - vai kāds no jums gadījumā nav speciālists bioķīmijā, vai tādu nepazīst, kas spētu izfunktierēt uzdevumus par nukleotīdu metabolismu par kādām naudiņām, noteiktā laikā? ļoti ļoti vajadzīga palīdzība. Uzdevumi nav viegli.
Ja ir, lūdzu dodiet ziņu šiten pat. Varu nosūtīt materiālus ieskatam, kas ir vajadzīgs.
Paldies!
Jautājums sekojošs - vai kāds no jums gadījumā nav speciālists bioķīmijā, vai tādu nepazīst, kas spētu izfunktierēt uzdevumus par nukleotīdu metabolismu par kādām naudiņām, noteiktā laikā? ļoti ļoti vajadzīga palīdzība. Uzdevumi nav viegli.
Ja ir, lūdzu dodiet ziņu šiten pat. Varu nosūtīt materiālus ieskatam, kas ir vajadzīgs.
Paldies!
from:
laboratorija
date: Dec. 1., 2010 - 08:12 pm
#
Atbildēt | Diskusija
from:
le_minga
date: Dec. 1., 2010 - 08:37 pm
#
Atbildēt | Iepriekšējais
Līdzsvaram.
from:
digna
date: Dec. 1., 2010 - 08:43 pm
#
Atbildēt
from:
susure
date: Dec. 1., 2010 - 08:51 pm
#
Nez... vai nu LU ķīmiķos vai drīzāk RSU. Tur lielākā daļa tāpat medīķi, kas bioķīmiju labi saprot. Un par pieticīgām naudiņām gan jau kāds palīdzēs, tikai rēķinies ka savu daļu žults arī saņemsi
Atbildēt | Diskusija
from:
laboratorija
date: Dec. 1., 2010 - 09:08 pm
#
Atbildēt | Iepriekšējais
from:
psiihe
date: Dec. 1., 2010 - 09:48 pm
#
Manā gadījumā ir bioķīmijas pasniedzējs, kura uzdevumus nesaprot pat ķīmiķi ( ir sūtīts vairākiem vecāko kurstu studentiem), un mediķi arī, tāpēc meklēkju palīdzību no kāda, kam ir tiešām lielas zināšanas, jo uzdevumus pašu spēkiem nav iespējams izpildīt tiem, kas nav hausi bioķīmijas nozarē.
Lūdzu konstruktīvas atbildes, nevis dienas negāciju atraugas. Paldies.
Atbildēt
from:
komeeta_naak
date: Dec. 1., 2010 - 09:55 pm
#
es neesmu specs, bet varu paskatīties (haha, kā anekdotē par ginekologu). komeeta.naak at gmail punkts com. galīgi neko nesolu, a ja nu tomēr...
Atbildēt | Diskusija
from:
psiihe
date: Dec. 1., 2010 - 10:04 pm
#
Paldies par atsaucību! Aizsūtīju piemēru.
Atbildēt | Iepriekšējais | Diskusija
from:
komeeta_naak
date: Dec. 1., 2010 - 10:06 pm
#
Atbildēt | Iepriekšējais | Diskusija
from:
psiihe
date: Dec. 1., 2010 - 10:13 pm
#
Atbildēt | Iepriekšējais
from:
psiihe
date: Dec. 1., 2010 - 10:18 pm
#
Te piemērs, ja nu kādam ir interese.
Atbildēt | Diskusija
from:
walkire
date: Dec. 2., 2010 - 02:42 am
#
Atbildēt | Iepriekšējais
from:
jaranga
date: Dec. 1., 2010 - 10:28 pm
#
īstenībā pat es,kurai vel bioķimija ir priekšā, aptuveni saprotu to fišku,bet tas 4. uzdevums ir pagrūts. Būtu ko tadu lasijusi,butu elementari. Es iesaku tev meklēt kādu farmaceitu,jo mums bioķimija ir IV semestrī. Meklē kādu V VI semestra studentu, kaut vai LU vai RSU domubiedros. atsaucībai vajadzētu būt.
Veiksmi
Atbildēt | Diskusija
from:
psiihe
date: Dec. 1., 2010 - 10:35 pm
#
Paldies par atsaucību!
Atbildēt | Iepriekšējais
from:
krokomots
date: Dec. 2., 2010 - 01:38 am
#
Atbildēt
use google and wiki
from:
ezss
date: Dec. 2., 2010 - 03:36 am
#
pirmais, ko piedāvā google par proteīnu translāciju, ja papildus ieraksta 5' 3'
1. Initiation
•The small subunit of the ribosome binds to a site "upstream" (on the 5' side) of the start of the message.
•It proceeds downstream (5' -> 3') until it encounters the start codon AUG. (The region between the cap and the AUG is known as the 5'-untranslated region [5'-UTR].) bla bla bla
Kas nozīmē, ka nolasīšana sākas no 5' gala un jo tuvāk 3'galam, jo ķēde garāka. Attiecīgi apgalvojums ir nepareizs
Es varētu pabakstīties, bet ne ātrāk kā brīvdienās. Tāpat es tev neuzrakstīšu atbildes, bet gan varu sakopēt tekstus no kā tu pate varēsi uzkonstruēt atbildi.
Nav man nekāda prieka kādam pelnīt atzīmi. man prieks būs, ja tu sapatīsi un iemācīsies
Atbildēt
pēc transkripcijas modifikācija un mol bio in nutshell
from:
ezss
date: Dec. 2., 2010 - 05:47 am
#
Značit.
Pamatā ir divi pēctranskripcjas, jeb mRNS apstrādes mehānismi - intronu (to vietiņu, kas ir gēnos un nekodēs tālāko proteīnu sekvenci) izgriešana un eksonu salipināšana un mRNS galu apstrāde. Saites - http://www.execulink.com/~ekimmel/mrna_
Ja bildītes un anmācija tev nepalīdz pie 4. jautājuma, tad lasi tālāk
Lai būtu skaidrs, kas tie par tādiem mazburtu savienojumiem, ko es te plaši lietoju, ir runa, es tev arī uzrakstīšu atkārtoti tā saucamo centrālo molekulārās bioloģijas dogmu.
To, ka kodola galvenā funkcija ir glabāt ģenētisko materiālu, tu gan jau ka zini. Un to, ka ģenētiskā info stāv ierakstīta DNS, gan jau ka arī briesmīgais bioķīmijas pasniedzējs jums ir apstāstījis. Pati DNS kā molekula ir diezgan inerta (tā ir dubultspirāle un viņai pašai ar sevi ir interesanti un nevienu citu viņai nevajag), tāpēc mēs nevaram sagaidīt, ka viņa veiks kādus ļoti aktīvus procesus mūsu šūnās. Savukārt, ja šūnas ir dzīvas un darbīgas, tad viņas visu laiku grib kaut ko darīt ar tām molekulām jeb vieliņām, kas viņā ienāk iekšā un DNS tur ir mazpielietojams. Šo problēmu šūna atrisina ar vairākpakāpju informācijas pārnesi un aktīvu molekuli izveidi beigās.
Ja mēs attēlotu ar bultiņām kā notiek šī info pārnese, tad mums sanāktu šāda ķēdīte DNS->RNS->Proteīni. Proteīni jeb olbaltumvielas, tad lielākoties arī ir tie darbarūķi, kas veic visu darbu šūnā - pārvērš glikozi enerģijā, CO2 un H2O vai alkoholu tajā pašā CO2, H2O un pohās.
Sākumā mums ir DNS, tad atnāk RNS polimerāze un nolasa to informāciju, ko satur DNS (jeb vienkāršāk runājot, pārkopē burtiņu secību no DNS) uz RNS molekulu. Šo procesu sauc par transkripciju, jeb pārrakstīšanu, jo būtībā no 4u dažādu nukleotīdu secības mēs iegūstam to pašu nukleotīdu secību tikai vienpavediena molekulas veidā.
Vienpavediena molekula jau ir daudz reaģēt spējīgāka un viņa piesaista ribosomu, kas spēj iztulkot atgctagcca proteīnu valodā. Cilvēkam olbaltumvielas sastāv no 20 aminoskābēm. Ir skaidrs, ka 20 lietas nevar nosaukt katrai piešķirot vienu nukleotīdu, jo tad burtiņu pietiek tikai 4ām aminoskābēm. Arī ar burtu pārīšiem nepietiek, jo tad var izveidoties 4x4=16 kombinācijas, kas arī ir par maz. Tādēļ vienu aminoskābi kodē 3 nukleotīdi (4x4x4=64). Ribosoma uzsēžas uz RNS 5'gala un šļūc uz priekšu. Kad viņa savā ceļā sastop AUG, tad viņa sāk proteīnu sintēzi lasot katru trijnieku un piemeklējot atbilstošo aminoskābi. Tā kā nukleotīdi tiek pārtulkoti par aminoskābēm (viena ķīmisko savienojumu grupa par otru) šo procesu sauc par translāciju.
par 5'un 3'galiem - tie ir zinātnieku ieviesti apzīmējumi, lai spētu atšķirt vienu galu no otra. ja skatās uz DNS molekulu
tad var ievērot, ka nukleotīdi savā starpā ir savieni ar fosfātu saitēm (sarkanie rimbu;li ar P). Katram fosfātam viena saite saistās pie nukleotīda cukura (bildē zilais piecstūris) 3. un vien pie 5. oglekļa atoma. Bet galos ir brīva piesaistes vieta pie 3. vai 5. atoma. Pēc tā arī atšķir 3' un 5' galus DNS un RNS molekulām - pēc tā pie kura cukura ir "brīvs". Pēc līdzīga pricipa- galā palikušajām brīvajām grupām arī atšķir proteīnus, tikai tur ir peptīdu saite un C un N gali.
Atbildēt | Diskusija
Re: pēc transkripcijas modifikācija un mol bio in nutshell
from:
jaranga
date: Dec. 2., 2010 - 01:44 pm
#
Atbildēt | Iepriekšējais
pēc transkripcijas modifikācija un mol bio in nutshell 2
from:
ezss
date: Dec. 2., 2010 - 05:48 am
#
Pirmais no tiem - gēni ir daudz garāki un tajos atrodas nekodējoši fragmenti, jeb introni. Tā kā no viņiem nav nekādas jēgas proteīnu taisīšanā, tos pirms translācijas izgriež ar tā saucamo splaisinga mehānismu. Ir samērā komplicēts enzīms, jeb splaisosoma, kas sastāv no vairākām olbaltumvielām, kuras galvenais uzdevums ir atrast intronus, izgriezt tos no proteīnus kodējošās mRNS un salipināt mRNS atpakaļ, lai ribosoma vēlāk varētu netraucēti šļūkt pa RNS un ķibināt kopā proteīnu.
Tāpat eikariotu šūna ir daudz aizdomīgāka un kuru katru RNS netulkos par proteīnu, kas zin', iespējams, ka beigās sanāks vīruss. Tādēļ šūna iezīmē savējos mRNS piekabinot tiem 5'galā G un 3' galā poliA, jeb vairākus AAAA. Šī sekvence tad palīdz šūnām atpazīt, ka šis mRNS nav jāiznīcina un arī palīdz piesaistīt tālākos translācijai nepieciešamos enzīmus.
Lai savienotu divas DNS molekulas, ja abām galā ir fosfāti, vienai no viņām ir nepieciešams nogriezt galā esošo fosfātgrupu, lai no 2 molekulām, kas beidzas ar cukurs-fosfāts, varētu veidot savienojumu cukurs-fosfāts-cukurs. To dara enzīmi, ko sauc par sārmainajām fosfotāzēm.
Tavā uzdevumā ir minēti savienojumi pGUUCp un ACCG, šajā gadījumā p apzīmē fosforgrupu galā un no tā tev vajag izveidot ACCGGUUCAAAA. Pēdējais, ko teikšu priekšā, ka šo procesu var aprakstīt kā ACCG+(pGUUCp - p)+AAAA Tā kā es nezinu īsti, ko jūsu pasniedzējs ir domājis ar pGUUCp (t.b. cik tur to fosfātu ir - viens vai arī viens papildus esošajam), bet to viņš noteikti būs minējis lekcijās. Paskaties pieraktos, rūpīgi izlasi augšējo palagu un es ticu, ka tu varēsi izpildīt 4. uzdevumu un iespējams arī pārējos, jo es te sarakstīju vēl čupu visādas standarta bioķīmijas info. :)
Lai veicas! (tagad pretendēju uz kartupeļa medaļu par garāko komentāru pajautā komūnā šomēnes, līdz šim nebiju saskārusies ar to 4000 zimbolu ierobežojumu :) )
Atbildēt | Diskusija
Re: pēc transkripcijas modifikācija un mol bio in nutshell 2
from:
psiihe
date: Dec. 2., 2010 - 08:48 am
#
Atbildēt | Iepriekšējais | Diskusija
Re: pēc transkripcijas modifikācija un mol bio in nutshell 2
from:
bloom
date: Dec. 2., 2010 - 05:12 pm
#
;)
he- he...
Atbildēt | Iepriekšējais | Diskusija
Re: pēc transkripcijas modifikācija un mol bio in nutshell 2
from:
psiihe
date: Dec. 2., 2010 - 09:09 pm
#
Atbildēt | Iepriekšējais