Vienkāršoti ņemot.

Ir šo olbaltumvielu "uzvešanās" (pat to spilvens solīja uzrakstīt) modelis, kas aprakstīts matemātiski. Programma kalkulē (prognozē / simulē) olbaltumvielas izturēšanos reālos apstākļos. Laboratorijas eksperimenti ir parādījuši, ka šis modelis darbojas. Tas nozīmē, ka nevajag veikt dārgus laboratorijas eksperimentus, bet var izkalkulēt matemātisko modeli, kas ir daudzmaz ekvivalents reālajiem procesiem dabā.

WU (work unit) ir darba vienība. Programma saņem no centrālā servera vienu darba vienību, izkalkulē pēc matemātiskā modeļa lielu datu apjomu un nosūta rezultātus atpakaļ uz centrālo serveri. Tas notiek pa datu gabaliņam. Viens gabaliņš ir viens work unit. Pēc katra gabaliņa nosūtīšanas tiek saņemts un kalkulēts nākošais. Jo ilgāk programma griežas, jo vairāk WU tiek izkalkulēti. Vienam work unit, atkarībā no procesora jaudas un gabaliņa sarežģītības, paiet no dažām stundām līdz pat nedēļai vai vairāk. Jo sarežģītāks gabaliņš, jo vairāk punkti tiek ieskaitīti.