(Imho) Senos laikos bija tā, ka tiešām bija svarīgi, lai cilvēki dzemdē daudz bērnus, jo pasaule bija daudz bīstamāka, un tā kopiena/valsts, kurai bija vairāk cilvēku, tā tad arī bija tā stiprākā utt. Un tas uzsvars uz kolektīvajām vērtībām iedēstījās reliģijā (un vēlāk arī nacionālismā), un viena no tā izpausmēm ir homofobija. Jo agrāk tiešām homoseksuāļiem nebija iespējams dabūt bērnus, un tas varēja apdraudēt visu sabiedrību.
p.s Ļoti daudzas citas reliģijas arī ir homofobas, piemēram, islāms.